Todos y cada uno de los institutos Carnot se comprometen firmemente a desarrollar su actividad de I+D en pro de la innovación empresarial (pymes, empresas de capitalización media y grandes empresas), y la observancia por parte de los institutos Carnot (que son 37, más 2 efectuando un periodo de prueba de 18 meses) de los requisitos impuestos por esta certificación es objeto de evaluaciones periódicas. Como contrapartida, los institutos Carnot reciben ayuda financiera, que se calcula en función del volumen de actividad colaborativa y que se destina a respaldar las actuaciones necesarias para dar cumplimiento a los compromisos asumidos.
La red de institutos Carnot está federada por la Association des instituts Carnot (Ai Carnot), que se encarga de administrar y promover las actuaciones de toda la estructura.